La tourbière de la Vergne Noire a pour origine le comblement d'un lac. Les sédiments déposés au fond du lac ont été datés au carbone 14. Ils sont âgés de 8500 ans.
En bordure du lac, une ceinture de végétation composée de plantes hygrophytes s'est développée. Certaines de ces plantes ont formé des radeaux ou tremblants, flottant en surface du lac. Ces radeaux accueillent une végétation tourbogène, essentiellement composée de sphaignes. Ce stade d'évolution est encore visible sur les lacs lozériens tout proche (lacs de Salhiens et de Souveyrols). La végétation tourbogène, en produisant de la tourbe, a fini par combler l'ensemble du lac.
Actuellement, on observe au centre de la tourbière, une végétation à base de tapis et buttes de sphaignes, sillonnée par de petites gouilles* remplies d'eau, derniers indices de l'ancien lac.